第二代生物燃料指的是擺脫利用玉米等糧食作物為原料轉(zhuǎn)化為生物燃料的應用模式，繼而以麥稈、草和木材等農(nóng)林廢棄物為主要原料，采用生物纖維素轉(zhuǎn)化為生物燃料的模式，發(fā)展纖維素乙醇；

第三代生物燃料則指木質(zhì)素降解利用，第二代和第三代生物燃料原料多來自植物秸桿等廢料，不會產(chǎn)生與人爭糧的情況；利用降解材料作能源，還有利于發(fā)展循環(huán)經(jīng)濟。

但是，由于第二代生物燃料的技術(shù)成本太高一直未能大規(guī)模使用。自2008年以來，傳統(tǒng)石化燃料價格飛揚，使用大量糧食轉(zhuǎn)化生物燃料導致全球范圍的糧荒，第一代生物燃料飽受詬病，原料價格不斷高漲，而同時，世界對能源的需求仍呈現(xiàn)不斷上升的趨勢。在這種局勢下，第二代生物燃料的優(yōu)點顯現(xiàn)，其技術(shù)成本也基本和傳統(tǒng)石化燃料以及第一代生物燃料成本持平，大規(guī)模的利用即將成為現(xiàn)實。